Ainda não foi desta vez que um time tocantinense conseguiu passar para a segunda fase da Copa São Paulo de Juniores. Em sua despedida na Copinha, o Araguaína perdeu para o Vila Aurora, de Rondonópolis (MT), por 2 x 0. A partida aconteceu no Estádio da Arena da Fonte Luminosa, em Araraquara, no último domingo. Com este resultado, o Tourinho do Norte terminou na última colocação sem nenhum ponto. Antes já havia perdido para o Corinthians (5 x 0) e Ferroviária (2 x 1). O time se despediu com três derrotas. Rodrigo Reis, aos 17 minutos de primeiro tempo e Mota, aos 27 do segundo tempo, fizeram os gols do time matogrossense.
Esta foi a segunda participação do Araguaína na Copa São Paulo. Em 2009, jogando na cidade de São José dos Campos, a equipe venceu o São José por 3 x 1. Mas perdeu para o Internacional por 3 x 0 e Noroeste (SP) por 4 x 0.Na Copa São Paulo do próximo ano o representante do Tocantins será a equipe do Gurupi, atual campeã Estadual da categoria.
Participação do clube
2009
40ª edição da Copa São Paulo
Sede (São José dos Campos)
São José 1×3 Araguaína
Estádio Martins Pereira
Araguaína 0x3 Internacional
Estádio Martins Pereira
Noroeste 4×0 Araguaína
Estádio Martins Pereira
2010
41ª edição Copa São Paulo
Sede (Araraquara)
Araguaína 0 x 5 Corinthians
Arena da Fonte Luminosa
Araguaína 1 x 2 Ferroviária
Arena da Fonte Luminosa
Araguaína 0 x 2 Vila Aurora (MT)
Arena da Fonte Luminosa
